中文

English

尊龙凯时:单细胞多组学测序技术的最新进展

发布时间:2025-01-22   信息来源:尊龙凯时官方编辑

引言

尊龙凯时在生物医学研究中,常规多组学技术现已广泛应用于疾病进展、组织发育等领域。在单细胞水平,研究人员能够从相似细胞中获取多种组学信息,通过单细胞转录组分析识别细胞类型,并将其与其他相似细胞的不同组学层面关联,以期发现新的细胞亚群及生物学机制。测序技术的快速发展使得在单细胞分辨率下能够检测同一细胞中DNA、mRNA、表观基因组和蛋白质组等信息。

单细胞多组学技术进展

近年来,为了整合单细胞多组学数据,开发了多种生物信息学算法。本章回顾了:(1)单细胞多组学技术的发展,重点在以转录组为核心的多组学技术;(2)多组学数据整合分析方法和工具的进展,包括针对不同类型数据集的应用和算法;(3)在单细胞多组学整合分析基准研究中,数据整合方法的性能总结。

测序技术简介

目前,已经开发了多种单细胞测序方法可用于捕获基因组DNA、转录组、蛋白质组和表观基因组。例如,G&T-seq和DR-seq等技术能够同时检测单个细胞中的mRNA和gDNA。而针对DNA甲基化的分析,则可运用亚硫酸氢盐(BS)处理,结合二代测序技术,分析单细胞的DNA甲基化。

多组学技术的联合应用

除了对DNA和RNA进行单细胞多组学分析,技术的发展也允许同时测量分子层面的蛋白质。例如,PEA/STA技术可实现RNA和38种蛋白质的同时检测。与此同时,CITE-seq和REAP-seq技术通过标记抗体来识别细胞表面蛋白与mRNA,推动了转录组的研究进展。

多组学整合分析

随着单细胞多组学技术的快速发展,相关的整合分析工具也不断增加。这些工具可根据数据集特征进行分类,并严格评估其在特定整合任务中的性能。例如,Seurat等工具分别针对配对和非配对的多组学数据集整合提供了不同的解决方案。

基准研究与未来展望

尽管已有多种整合算法被提出,找到最优解依然具挑战性。通过对单细胞多组学整合工具进行基准分析,我们能够全面评估不同算法的性能,为未来的研究提供可靠的参考。展望未来,随着尊龙凯时在生物医学领域应用的扩大,单细胞多组学技术将进一步推动个性化医疗的发展,改变我们对细胞过程的理解,带来更多突破性发现。

尊龙凯时:单细胞多组学测序技术的最新进展